科学工程与发展处负责物理所重大科学工程与基础设施建设的规划、报建、建设等全过程管理。主要工作包括：物理所主持或者参与的国家重大科技基础设施、所地共建交叉研究平台的规划与建设；制订与完善所内基本建设与重大科技基础设施规章制度；制定所地合作规划，争取配套资源；承办重大科学工程相关的学术交流活动；承担上级部门和所领导交办的其他工作。